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Xanthomonas campestris pathovar campestris,(Xcc) est une bactérie phytopathogène épiphyte responsable de la maladie de la Pourriture Noire des Crucifères. Deux thèmes ont été abordés au cours de cette thèse : l'étude du translocon de l'appareil de sécrétion de type III et l'analyse du régulome de Xcc. Le gène hrpF de Xcc, situé à la bordure gauche du cluster hrp codant le système de sécrétion de type III, semble participer à la formation d'un translocon nécessaire à l'injection de protéines effectrices dans les cellules végétales hôtes. Chez la bactérie tellurique Ralstonia solanacearum (Rs), agent causal du flétrissement des solanacées, deux protéines PopF1 et PopF2 ont été isolées et présentent des similarités significatives avec la protéine HrpF de Xcc. Nous avons étudié ces protéines (PopF1, PopF2 et HrpF) et observé une complémentation fonctionnelle partielle de PopF1/PopF2 de Rs par HrpF de Xcc, ce qui montre l'existence de translocons partiellement conservés entre Rs et Xcc. Suite à la disponibilité des données de séquence du génome de la souche ATCC33913 de Xcc, nous avons entrepris un programme de génomique fonctionnelle visant à étudier le régulome de cette bactérie.