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La grammatica e la sintassi del genoma e la composizione del proteoma delle specie streptococciche nel microbioma umano sono il risultato di un complesso processo di ottimizzazione tra selezioni, mutazioni e adattamenti di questi microrganismi in nicchie corporee distinte. Le loro relazioni filogenetiche e le specificità di nicchia agiscono di concerto e spesso portano all'accumulo di nuove proteine ed enzimi per diversificare le loro necessità biochimiche.