La quema in situ de residuos de cultivos, practicada por la mayoría de los agricultores del noroeste de la India, deteriora la calidad del suelo y del medio ambiente. Los hongos tienen potencial para la degradación de la lignocelulosa y pueden utilizarse para la descomposición in situ de los residuos de cultivos. Las especies de hongos Aspergillus terreus, A. flavus, A. niger y Penicillium janthinellum fueron aisladas y evaluadas en función de la actividad de las enzimas lignocelulolíticas para la degradación potencial de los residuos de cultivos. A. flavus y A. terreus mostraron una degradación del 30% de los residuos tras 10 días de incubación y estos hongos no mostraron ningún efecto secundario sobre el crecimiento del cultivo de trigo en condiciones de campo. Se encontró que la diversidad de hongos aumentaba con las prácticas de gestión basadas en la AC, las secuencias máximas de phylum estaban en el orden de Ascomycota> Basidiomycota> Glomeromycota. Sin embargo, Alternaria, Cercophora y Epicoccum fueron los géneros fúngicos más abundantes. A nivel de filo, la abundancia relativa de Ascomycota osciló entre el 55% y el 74%, registrándose la mayor dominancia en los sistemas de maíz basados en la AC (maíz-trigo-mungo) y la menor en los convencionales arroz-trigo; sin embargo, a nivel de clase, la mayor abundancia correspondió a Sordariomycetes, seguido de Dothideomycetes y Eurotiomycetes.
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