Se ha observado que el suelo de las explotaciones ecológicas presenta una mayor diversidad biológica y actividad microbiana que el sistema de agricultura convencional. Principalmente, la agricultura ecológica ha mejorado los indicadores biológicos de calidad del suelo: Carbono de la biomasa microbiana (CBM), Nitrógeno de la biomasa microbiana (NBM), actividades enzimáticas y diversidad microbiológica del suelo. En la mayoría de los casos, el aumento de la biomasa microbiana fue superior al 50%. Asimismo, los beneficios medioambientales de la agricultura ecológica son mayores que los de la agricultura convencional, con una armonía ecológica natural. Sin embargo, aún queda mucho por explorar en el campo de la agricultura ecológica, especialmente en los países en vías de desarrollo, incluido Nepal. El marco jurídico con la investigación científica relativa a la agricultura ecológica debe explorarse más para el desarrollo de la agricultura ecológica en Nepal.
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