Los microorganismos asociados a los entornos termales marinos se describen generalmente de cuatro maneras en función de su hábitat: los que se encuentran en los espacios de los poros y las grietas debajo de las superficies; los que se encuentran en la superficie exterior de los depósitos de sulfuro, normalmente en forma de alfombras; los que se encuentran sobre y dentro de los invertebrados, a menudo como simbiontes, y los que se encuentran dentro de la pluma de fluido hidrotermal en el agua de mar suprayacente. En un estudio se utilizó una cepa de Bacillus moderadamente termófila, que crece a 55-65ºc. Asimismo, 10 cepas de pseudoalteromonas sp que reducen el teluro y el selenito y que crecen a 40-50ºc. Los microorganismos son esenciales para la colonización inicial y requieren un contacto físico entre las bacterias colonizadoras y entre éstas y su huésped. La mineralización biológica pasa por dos procesos. Por un método, la mineralización es orquestada por el organismo a través de un proceso "mediado por la matriz orgánica". El otro método se caracteriza por la formación de minerales extracelulares/intercelulares en masa. Este proceso biológico da lugar a productos cristalinos similares a los esperados por la cristalización a partir de soluciones.
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