O Alinhamento de Sequências Múltiplas (MSA) é um dos mais importantes temas de pesquisa em Bioinformática. É útil em muitas aplicações como classificação de famílias e domínios, identificação de padrões, recentemente, as vantagens dos métodos desenvolvidos para o Alinhamento Múltiplo de Sequências têm sido utilizadas na resolução de muitos problemas dos sistemas computacionais. O objectivo deste trabalho é obter o melhor Alinhamento Múltiplo de Sequências através do foco no tempo e parâmetros de armazenamento, este objectivo tem sido feito desenvolvendo e comprovando o desempenho do Algoritmo Genético para encontrar o melhor (pontuação máxima) alinhamento múltiplo entre sequências.
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