Molti maliani e nigeriani sono fuggiti dai combattimenti e dalle violenze che si stavano verificando soprattutto nelle aree di Ménaka e Anderamboukane, nel nord-est del Mali. Il numero totale di persone che hanno attraversato il confine è stato stimato in 57.618, di cui 54.546 maliani e 3.072 nigeriani al 3 settembre 2012. La maggior parte delle persone fuggite dagli attacchi e dalle rappresaglie ha attraversato il confine con il Mali a piedi, su carri o asini, in condizioni difficili, senza rifornimenti e senza accesso all'acqua potabile e al cibo. Questa situazione di crisi ha creato enormi bisogni umanitari e aumentato la vulnerabilità delle popolazioni rifugiate. Questi bisogni includono protezione, istruzione, riparo, beni alimentari e non, salute, nutrizione e accesso all'acqua, all'igiene e ai servizi igienici. La crisi è anche un fattore aggravante della crisi alimentare e nutrizionale.