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Il cotone è una delle principali colture di fibre e semi oleosi in molte aree tropicali del mondo e una delle principali colture da reddito del Pakistan. La produzione di cotone è diminuita consecutivamente negli ultimi anni a causa di vari tipi di stress biotici e abiotici. La malattia dell'arricciamento fogliare del cotone (CLCuD) è la principale minaccia alla produzione e alla qualità del cotone in molti Paesi produttori, tra cui il Pakistan. L'unico modo per affrontare questa sfida è sviluppare nuovi genotipi resistenti alla CLCUD e aumentare il potenziale di resa dei genotipi disponibili. Le strategie di selezione di varietà ad alto potenziale basate su conoscenze scientifiche e agronomiche sono un buon modo per raggiungere questo obiettivo. Sia la qualità che la quantità della fibra sono obiettivi importanti da migliorare. L'analisi genetica è uno dei migliori strumenti per sfruttare il potenziale delle specie da applicare su scala commerciale.