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Les stress abiotiques - températures extrêmes, salinité, sécheresse- constituent un défi agronomique majeur en raison de leur impact négatif sur la croissance et le développement végétal. L'étude des réponses apportées par différentes espèces de plantes à ces stress est un aspect incontournable de toute stratégie d'amélioration variétale, et offre un modèle de choix pour l'étude intégrative de mécanismes qui opèrent à différents niveaux d'organisation biologique, selon des modalités hautement régulées. L'abondance de collections de génotypes et le progrès des outils d'analyse moléculaires, couplés à des traitements bioinformatiques performants, ont ouvert la perspective de caractériser la plasticité phénotypique de plantes modèles, à l'échelle génomique et dans un contexte environnemental dynamique. La métabolomique en particulier, définie comme l'analyse quantitative non ciblée des métabolites d'un échantillon biologique, permet d'observer de nombreux processus physiologiques tels que la nutrition, l'adaptation biochimique et ultrastructurale, ou encore la signalétique cellulaire. Cette thèse est une analyse métabolomique des réponses aux stress abiotiques.