Muitos malianos e nigerianos fugiram dos combates e da violência que ocorria principalmente nas zonas de Ménaka e Anderamboukane no nordeste do Mali. O número total de pessoas que atravessaram a fronteira foi estimado em 57.618, incluindo 54.546 malianos e 3.072 nigerianos a partir de 3 de Setembro de 2012. A maioria das pessoas que fugiram dos ataques e represálias tinham atravessado a fronteira do Mali a pé, em carroças ou em burros, em condições difíceis, sem abastecimento e sem acesso a água potável e alimentos. Esta situação de crise criou enormes necessidades humanitárias e aumentou as vulnerabilidades das populações refugiadas. Estas necessidades incluem protecção, educação, abrigo, produtos alimentares e não alimentares, saúde, nutrição e acesso à água, higiene e saneamento. A crise é também um factor agravante na crise alimentar e nutricional.