O câncer de mama é o segundo tipo de neoplasia mais freqüente em mulheres no mundo, responsável por altas taxas de morbidade e mortalidade. A evolução no aspecto clínico do câncer de mama está associada a uma série de eventos que envolvem alterações moleculares importantes para o crescimento celular, proliferação, apoptose, angiogênese e metástase. Os mecanismos subjacentes à metástase linfonodal, o grau de divergência clonal e a variedade genômica que caracterizam tumores primários e metastáticos, contudo, permanecem mal compreendidos. O trabalho se refre a uma análise comparativa entre amostras pareadas de tumores primários de mama e metástases linfonodais, utilizando as metodologias proteômicas de eletroforese bidimensional e espectrometria de massa. Como resultado, o estudo revela proteínas identificadas com papel relevante na carcinogênese mamária, em processos de divisão celular, organização do citoesqueleto, diferenciação, proliferação e apoptose. Variações na expressão dessas proteínas podem definir possíveis marcadores de prognóstico no câncer de mama, ou ainda contribuir para o entendimento das vias biológicas responsáveis pela evolução da doença.