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Trichoderma es un género de hongos de la familia Hypocreaceae que se encuentra en todo tipo de suelos y es el hongo cultivable más común. Se encuentran en todo el mundo y pueden aislarse fácilmente del suelo, la materia orgánica vegetal, la madera en descomposición, etc. Es un conocido agente de biocontrol agresivo y tiene un gran potencial de reproducción y colonización. En este estudio se evaluó la diversidad genética entre catorce aislados de Trichoderma (TBT- 01 a TBT- 14) utilizando diez marcadores SSR. Se recogieron muestras de suelo rizosférico de varias localidades de Uttar Pradesh, se diluyeron en serie y se sembraron en un medio selectivo de Trichoderma. Las colonias de los aislados se cultivaron puramente en agar papa dextrosa para aislar el ADN y realizar estudios moleculares. Se utilizaron diez cebadores SSR (SSR-01, SSR- 06, SSR- 08, SSR- 10, SSR- 11, SSR-13, SSR- 14, SSR- 15, SSR- 18 y SSR- 20) para la amplificación por PCR del ADN aislado.