La investigación consiste en analizar la reforma de los sistemas de salud de Colombia y Costa Rica en el periodo de 1990 -2008, mediante una investigación cualitativa con la metodología de comparación entre países (Cross National). Con manejo sistemático de datos comparados de los dos países y con la estrategia de análisis de variables y análisis de casos. Los resultados muestran similitud en la conformación político administrativa de los países y en las directrices impartidas por organismos financieros internacionales para la reforma del sector salud. Las diferencias están dadas por la decisión política de los gobiernos y la participación o no de la sociedad en el proceso de discusión y reforma de los sistemas de salud. Se concluye que hay consistencia y consolidación de la propuesta política de reforma del sistema de salud en Costa Rica contrario al sistema de salud colombiano.