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Colombia es un país inminentemente agrícola, lo cual hace evidente el uso de sustancias como los plaguicidas, que contrarresten los efectos nocivos de diversos organismos; estas sustancias pueden alterar considerablemente el ambiente, contaminando los ecosistemas y produciendo un efecto aún mayor sobre la biota. Por esta razón se hace necesario investigar y evaluar profundamente el grado de contaminación y de biodisponibilidad de contaminantes en el ambiente. Este trabajo se realizó con el fin de determinar la influencia del proceso de difusión en la concentración de Clorpirifos y TCP en el sedimento y la interfase agua-sedimento, y la influencia de las características fisicoquímicos de cada matriz y establecer que variables ambientales determinan la biodisponibilidad de estos plaguicidas en ambiente acuáticos. De esta forma se pretende contribuir al conocimiento del comportamiento natural de sustancias contaminantes introducidas al ambiente a través de actividades antrópicas.