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A saúde do tracto gastrointestinal (IG) é um factor chave para o desempenho biológico e eficiência dos animais produtores de alimentos. Um tracto gastrointestinal saudável assegura uma digestão e absorção óptimas dos nutrientes. O desenvolvimento e manutenção de uma saúde intestinal óptima depende fortemente da aquisição e manutenção de uma microbiota intestinal equilibrada. A microbiota intestinal de um animal é uma comunidade complexa de microrganismos dominada por bactérias. As bactérias do tracto intestinal variam em densidade e espécies nos diferentes compartimentos do intestino, dependendo do ambiente local. A microbiota intestinal desempenha um papel vital na saúde e no bem-estar do seu hospedeiro, proporcionando uma série de benefícios. A microbiota intestinal ajuda a digestão, protege contra agentes patogénicos, produz nutrientes e desempenha um papel no desenvolvimento e maturação dos tecidos intestinais e do sistema imunitário. Dentro da comunidade microbiana intestinal existem vários agentes patogénicos oportunistas que têm o potencial de causar doenças se tiverem a oportunidade de translocar através da barreira intestinal. A barreira intestinal é essencialmente uma única camada de epitélio que impede a passagem de bactérias para a mucosa intestinal.