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L'endosymbiose archaïque entraîne l'induction du phénotype de Warburg et une augmentation de la glycolyse ainsi qu'un dysfonctionnement mitochondrial. Cela conduit à une glycolyse anaérobie et au blocage du schéma de phosphorylation oxydative mitochondriale. Ceci est indiqué par un faible taux de coenzyme Q sérique et un faible taux d'ATP sérique. Une maladie mitochondriale médiée par un archaebactérie endosymbiotique est décrite. L'archée digoxine inhibe l'ATPase sodium-potassium de la membrane et induit une synthèse d'ATP médiée par l'ATPase sodium-potassium de la membrane. La maladie mitochondriale induite par les archées endosymbiotiques a été liée à la pathogenèse de la schizophrénie, des tumeurs malignes, du syndrome métabolique X, des maladies auto-immunes et de la dégénérescence neuronale.