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L'endosymbiose archéenne entraîne une carence en sélénium. L'archée utilise le sélénium pour synthétiser les sélénoprotéines archaïques. Cela entraîne une carence en sélénium au niveau cellulaire. La carence en sélénium entraîne une propagation rétrovirale défectueuse, car les rétrovirus contiennent des séquences de sélénoprotéines et ont besoin de sélénium pour les synthétiser. La carence en sélénium entraîne un dysfonctionnement de la glutathion synthétase et de la glutathion peroxydase, ce qui provoque un stress dû aux radicaux libres et une neurodégénérescence, un cancer, une maladie auto-immune et un syndrome métabolique. La carence en sélénium entraîne un défaut de conversion de la T4 en T3, car la déiodinase a besoin du sélénium comme cofacteur. La carence en sélénium entraîne une hypothyroïdie et une thyroïdite de Hashimoto. La carence en sélénium entraîne une cardiomyopathie et une pancréatite. La thyroïdite de Hashimoto consécutive à une carence en sélénium est associée à une maladie des petits vaisseaux cérébraux, à une hydrocéphalie à pression normale, à une encéphalopathie de Hashimoto, à une méningite auto-immune non vasculaire, à une démence auto-immune et à une encéphalopathie hyponatrémique récurrente. La carence en sélénium entraîne un syndrome cardiaque endocrinien et un syndrome neurologique.