La tortuga cabezona, Caretta caretta, es una especie clave en sistemas ecológicos marinos y costeros, favorece la resiliencia de los ambientes y mantiene el equilibrio de cadenas tróficas. Está catalogada por la UICN en peligro crítico de extinción. Con el objetivo de analizar el efecto de mutaciones puntuales sobre la estructura 2D y 3D de genes de ARNt mitocondrial, se obtuvo ADN genómico, se amplificaron por PCR y secuenciaron los genes ARNtLys, ARNtTrp y ARNtLeu en once tortugas cabezonas anidantes del Caribe colombiano. Las estructuras secundarias fueron inferidas con el programa ARWEN, y las estructuras terciarias con el programa RNA Composer 3D. Se identificaron dos polimorfismos en ARNtTrp y uno en ARNtLys específicos de Caretta caretta. En la posición nucleotídica 14 del ARNtTrp se identificó una timina que podría constituir un polimorfismo endémico de la colonia anidante del Caribe colombiano. Para el ARNtTrp se obtuvieron dos motivos 2D y tres 3D. Para los ARNtLys y ARNtLeu se obtuvo una estructura secundaria y una terciaria respectivamente, las cuales mostraron conformidad con las estructuras canónicas.