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O biofilme dentário é um ecossistema estável sob a forma de várias colónias microbianas que modificam a fisiologia caraterística da mucosa oral. É um ecossistema que substitui dinamicamente as células mortas e a sua maturidade permite-lhe formar um sistema circulatório primitivo. Este sistema controla a difusão ou expulsão de nutrientes ou outras substâncias de acordo com as necessidades do biofilme. Esta caraterística dá-lhe a aparência de uma entidade viva com integridade por direito próprio. O biofilme dentário é uma entidade dinâmica e deve, portanto, ser estudado no seu contexto microbiológico. Os meios de exploração, nomeadamente a coloração, são ainda limitados. Esta dificuldade, para além das diferenças entre os ambientes e os indivíduos deste biofilme, deixa muitos mecanismos, nomeadamente interactivos, desconhecidos. É de salientar que os vírus bacteriófagos e as amebas existentes no biofilme dentário não são quantificáveis, o que significa que não é possível estudar as interacções biológicas de parasitismo (vírus bacteriófago - bactéria) e de predação (ameba - bactéria).