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Le rôle du microbiote intestinal est crucial pour le maintien de la santé humaine. Plusieurs études ont mis en évidence le rôle du microbiote intestinal dans la gestion des troubles métaboliques et mentaux, ainsi que des maladies du système cardiovasculaire et du système nerveux auto-immun. En général, le microbiote intestinal est impliqué dans la transmission de fonctions spécifiques dans le métabolisme des médicaments et des nutriments de l'hôte, dans la protection contre certains pathogènes, dans le maintien de l'intégrité structurelle de la muqueuse intestinale et dans l'immunomodulation. Ils sont généralement divisés en Bacteroidetes et Firmicutes. Le microbiote intestinal influence de nombreux domaines de la santé humaine, de l'immunité innée à l'appétit et au métabolisme énergétique. Certaines études ont récemment examiné le rôle vital du microbiote intestinal dans le métabolisme du cholestérol, probablement par le biais de cinq mécanismes différents : la modification du rapport entre les acides biliaires libres et les acides biliaires conjugués ; la fermentation des fibres alimentaires pour produire des acides gras à chaîne courte qui peuvent inhiber la synthèse du cholestérol ; l'expression génétique médiée par le microbiote pour le métabolisme du cholestérol ; la conversion du cholestérol en coprostanol faiblement absorbant ; et la réduction du cholestérol sanguin par l'inhibition des lipopolysaccharides.