Des études ont été menées pour isoler et caractériser la microflore intestinale des races pures et des croisements de vers à soie. L'énumération de la microflore intestinale a révélé que les tripes de CSR 2 abritaient une population de microflore significativement plus élevée, les bactéries étant dominantes (2,84 x 107cfu/ml), suivies par les champignons (1,66 x 104cfu/ml) et les actinomycètes (4,3 x 102cfu/ml). Parmi les neuf croisements évalués, PM X CSR 2 a enregistré un microbiote intestinal significativement plus élevé et trois croisements, à savoir BL43 x NB4D2, APM1 x APS8 et APM2 x MVT, ont enregistré des champignons intestinaux significativement plus faibles. En ce qui concerne les actinomycètes, PM X CSR 2 a enregistré une population significativement plus élevée de 2,3 x 102cfu/ml que tous les autres croisements évalués. La composition de la microflore intestinale du ver à soie montre que 80 % de la population totale était constituée de bactéries, avec des formes de bâtonnets (59 %), de coccus (15 %) et de coli (6 %).