Uma das grandes preocupações relacionadas aos sistemas de manejo agrícola adotado pelo homem reside nos efeitos sobre os processos biológicos que ocorrem no solo, cuja ação dentro dos ecossistemas visando à exploração agrícola, modifica a intensidade desses processos em virtude do emprego de práticas que objetivam exclusivamente a maximização da produção vegetal. Um dos desafios da pesquisa em biologia do solo é justamente entender os impactos do manejo sobre as complexas interações de todos os organismos edáficos ao nível de comunidade que são fundamentais na manutenção da qualidade do solo.
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