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O objectivo deste estudo era avaliar a distância genética entre onze variedades de algodão búlgaro e quatro macedónias, aplicando o método de análise de agregados. O ensaio foi realizado em 2008 e 2009. A análise de agrupamento baseada nas propriedades agronómicas e tecnológicas das fibras das variedades confirmou as diferenças genéticas entre elas. As variedades agrupadas em dois grupos básicos, dependendo das direcções de reprodução e dos métodos de reprodução. Algumas variedades eram geneticamente muito semelhantes e podiam ser incluídas num programa de reprodução para efeito de reprodução rápida. As variedades e linhas macedónias estavam geneticamente distantes de algumas variedades búlgaras e a sua inclusão num único programa de melhoramento pode ter um bom efeito. As condições do ano tiveram influência na semelhança genética e no afastamento genético como resultado da predeterminação de fórmulas genéticas que controlam os traços. Em Strumica as variedades diferenciavam-se mais fortes em rendimento e percentagem de cotão e mais fracas em comprimento de fibra.