A irrigação é uma parte essencial do sucesso do tratamento do canal radicular. Tem várias funções importantes, que podem variar consoante o irrigante utilizado: reduz a fricção entre o instrumento e a dentina, melhora a eficácia de corte das limas, dissolve os tecidos, arrefece a lima e o dente e, além disso, tem um efeito de lavagem e um efeito antimicrobiano/antibiofilme. A irrigação é também a única forma de afetar as áreas da parede do canal radicular que não são tocadas pela instrumentação mecânica. São utilizados diferentes meios de administração para a irrigação do canal radicular, desde a tradicional administração com agulha de seringa até vários sistemas accionados por máquinas, incluindo bombas automáticas e energia sónica ou ultra-sónica.