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Les rivières Mubanbiro, Shasha et kihira situées respectivement dans les groupements de Kamoronza, Mufunye et Shanga, collectivité de Bahunde, dans la cité de Sake. Notre travail concerne l'analyse bactériologique des eaux des rivières Shasha, Kihira et Mubambiro qui se déversent dans le lac Kivu. Les résultats des analyses bactériologiques des ces eaux de rivières sur différents milieux d'isolements (eau peptone et Lauril), et de culture a travers la méthode de numération et d'identification des germes au laboratoire de l'ISTM/Goma, nous ont conduit aux résultats suivants : Ces cours d'eaux ont une fréquence de germe supérieure à 104 germes/ml, sur les milieux d'identification gélose au sang frais et galerie de Leminor sur les milieux Kligler, MIU et Citrate, les bactéries suivantes ont été identifiées respectivement avec un pourcentage de 14,285 chacune : Salmonnella, Afnia Alvei, Enterobacter aerogene, Enterobacter cloaceae, Providacia alacalifaciens et Proteus vulgaris à 28,571%. De toutes ces bactéries isolées ; il y a le Salmonella Typhi, les Enterobacters aeroginosa et cloaceae qui sont pathogènes responsables entre autre de la fièvre typhoïde.