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Negli ultimi anni si è sviluppata, la consapevolezza della necessità di una maggiore sensibilità ambientale che presuppone il contrasto a pratiche agricole inappropriate (es. monocoltura, avvicendamenti brevi, lavorazioni intense e frequenti, largo impiego di fertilizzanti minerali). Tali pratiche infatti, possono portare nel lungo periodo ad una perdita della fertilità del suolo con una conseguente riduzione della sostenibilità delle produzioni. La comunità microbica presente nella rizosfera svolge un ruolo fondamentale per la sostenibilità delle produzioni agrarie. Nella rizosfera infatti avvengono complesse interazioni tra componenti biotiche e abiotiche tali da determinare modificazioni chimiche e fisiche del suolo favorevoli all'accrescimento delle colture. In particolare i microrganismi, attraverso vari meccanismi, possono favorire l'incremento della fertilità del suolo, lo stato fisiologico delle colture e il mantenimento in salute delle stesse.