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Dans le présent travail, une étude comparative de la biodégradation du naphtalène par des cellules libres et immobilisées dans l'alginate de calcium de Pseudomonas sp. a été réalisée dans des cultures en batch pour différentes concentrations initiales à la température 30°C et pH 7.0 . Un modèle pour la cinétique de biodégradation a été proposé afin de permettre le calcul du facteur d'efficacité et du modèle de Thiele, pour permettre d'évaluer la contribution des contraintes de diffusion du naphtalène dans le support sur la cinétique de conversion et sur le rendement global.