A Biologia de Sistemas é uma ferramenta poderosa amplamente utilizada para analisar em sistemas e subsistemas biológicos complexos de silício, para compreender o comportamento celular ao nível do sistema; que tipo de interacções são entre os componentes celulares e como é que estas redes estão organizadas e reorganizadas sob diferentes pressões, tais como condições ambientais severas, meio de cultura e mesmo modificações genéticas. No presente estudo são discutidas as aplicações de modelos metabólicos baseados em constrangimentos e biologia de sistemas na engenharia metabólica. Utilizando estas abordagens é analisado o potencial de produção de ácido succínico a partir de recursos renováveis (glucose ou glicerol em meios mínimos) na Escherichia coli. São feitas simulações para determinar que vias competitivas devem ser modificadas para redireccionar o fluxo de carbono para o ácido succínico e para determinar as condições ambientais e os efeitos da engenharia metabólica no metabolismo celular. Durante as experiências foram implementados métodos diferentes em silico e in vivo para modelar, analisar, optimizar e prever o comportamento metabólico da E. coli.