Les suivis de Boophis williamsi et Mantidactylus pauliani, deux amphibiens des cours d'eau, critiquement en danger (CR) et endémiques de l'Ankaratra ont été menés en quatre phases, relativement à la chronologie suivante: juin, août, novembre et décembre 2011. L'estimation de l'effectif total n par la méthode de Schnabel a été obtenue par le biais de la méthode de transect, la fouille systématique et le capture-marquage-recapture. Les effectifs généraux des adultes sont de sept pour B. williamsi et 224 pour M. pauliani, s'étalant sur 100 m de ruisseau. Elles varient avec l'altitude et la saison. Ces deux espèces ne vivent qu'à 2000 m et 2400 m d'altitudes. L'analyse morphométrique de ces dernières a démontré que la femelle a une taille supérieure à celle du mâle. La présente étude va aider à la connaissance des deux espèces, ainsi qu'un document aidant à leur conservation.