I biomarcatori forniscono un'indicazione precoce della presenza e/o degli effetti della contaminazione ambientale. Questi strumenti hanno il vantaggio di poter caratterizzare le modalità d'azione di un contaminante; alcuni biomarcatori sono relativamente specifici per un particolare tipo di contaminante. I biomarcatori possono essere utilizzati direttamente sugli organismi nativi dell'ambiente di interesse o come parte di biotest.L'attività dell'acetilcolinesterasi e il tasso di alimentazione sono due biomarcatori importanti per misurare l'effetto dell'esposizione agli inquinanti in diversi gruppi di invertebrati e pesci. Tuttavia, sembrano necessarie ulteriori ricerche per limitare gli artefatti coinvolti nell'interpretazione dei loro valori e per ottenere risultati sempre più efficaci.
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