Ein Biomarker oder biologischer Marker ist eine Substanz, die objektiv gemessen und als Indikator für einen normalen biologischen Prozess, einen pathogenen Prozess oder eine pharmakologische Reaktion auf eine therapeutische Maßnahme bewertet wird. Ein idealer diagnostischer Marker sollte das Vorhandensein eines Krankheitsprozesses anzeigen, bevor größere klinische Schäden aufgetreten sind. Im Bereich der Parodontologie sind die herkömmlichen klinischen Kriterien oft unzureichend, um aktive Krankheitsherde zu bestimmen, das Ansprechen auf eine Therapie zu überwachen oder den Grad der Anfälligkeit für ein künftiges Fortschreiten der Krankheit zu messen. Biomarker tragen zum Wissen über die klinische Pharmakologie bei und bilden die Grundlage für die Planung klinischer Studien, mit denen sich Sicherheit und Wirksamkeit rasch und eindeutig bewerten lassen. Forscher im biotechnologischen und medizinischen Bereich untersuchen derzeit die Verwendung von Mundflüssigkeiten für die Diagnose oraler und systemischer Krankheiten und für die Entwicklung von Medikamenten. Die Entwicklung eines breiten Spektrums von Markerfaktoren wird ein Hauptziel der Parodontalforschung sein.