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Le but de cette étude est d'évaluer l'effet qu'exercent les hydrocarbures pétroliers sur les communautés bactériennes sédimentaires marines et de mettre en évidence la validité de l'utilisation des acides gras phospholipidiques (AGPL) comme biomarqueurs en écologie microbienne. La démarche adoptée à consisté à analyser: (1) la biotransformation d'hydrocarbures dans des cultures pures, sur des microcosmes ainsi qu'au niveau d'expérimentations in situ. (2) la composition en AGPL. Nous avons pu mettre en évidence que les communautés microbiennes sédimentaires réagissent et modifient leur composition en AGPL en réponse à une contamination artificielle par des hydrocarbures. L'analyse des AGPL s'est montrée efficace pour mettre en évidence les modifications lipidiques globales au sein des sédiments qui sont la résultante de l'effet des hydrocarbures sur les membranes bactériennes et des modifications structurelles des communautés.