Este trabalho, perante a produção de álcool combustível de primeira e segunda gerações, trata da gestão da inovação e dos gargalos tecnológicos e de logística para a compactação da cana-de-açúcar pela tecnologia de briquetagem. O processo de briquetagem é essencial para que a biomassa seja recolhida e compactada a partir da tecnologia de compactação por briquetagem, cujo produto final pode ser utilizado em energia. A atual configuração deste cenário está na baixa eficiência, pela pouca adesão da briquetagem. A briquetagem é muito influenciada pela logística, uma vez que esta não possui canais de comercialização e distribuição próximos ao setor industrial de fabricação dos briquetes, inviabilizando o processo. Porém, a compactação possui vantagens econômicas que permitem uma alavancagem do setor, pela eficiência produtiva. Foram abordados, de modo prospectivo, os gargalos que norteiam os sistemas de briquetagem e logístico, e seus impactos na configuração atual do emprego da briquetagem pelas usinas, e da relação que este possui com os sistemas logísticos.