Sempre que a dentina é cortada com instrumentos manuais ou rotativos, os tecidos mineralizados não são triturados ou clivados, mas despedaçados para produzir quantidades consideráveis de detritos. A camada de esfregaço numa cavidade e no canal radicular pode não ser directamente comparável. Não só os instrumentos de preparação da dentina são diferentes nas cavidades coronárias, mas no canal radicular os números dos túbulos dentinários mostram uma maior variação e é provável que haja mais restos de tecido mole presentes. A limpeza mecânica e química do canal radicular é a principal apreensão do tratamento endodôntico. Contém também uma camada de esfregaço que é uma camada superficial irregular. É amorfo e cobre as paredes do canal radicular. Isto é devido à instrumentação das paredes do canal. A instrumentação mecânica e a irrigação meticulosa com desinfectantes é necessária para uma desinfecção adequada do canal radicular. Os métodos actuais de remoção de esfregaços incluem técnicas químicas, ultra-sónicas e laser - nenhuma das quais é totalmente eficaz ao longo de todos os canais ou é universalmente aceite.