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O estudo detalhado da papaia foi avaliado com base nas diferenças de características morfológicas e anatómicas. Estas incluem o estudo da morfologia e anatomia das folhas, anatomia das raízes e pecíolos, estrutura floral e morfologia dos frutos. O número de segmentos principais das folhas, largura da folha, distribuição estomatológica, e feixe vascular, tipos de flor e forma dos frutos foram os caracteres importantes utilizados para a caracterização das cultivares de papaia. A fim de estudar a anatomia da folha, foi utilizado o método da cera de parafina. A anatomia da raiz e do pecíolo foi estudada através da realização de secções finas das mãos, utilizando uma lâmina metálica afiada. As flores e os frutos foram avaliados quanto à sua forma e tamanho. Os resultados obtidos indicaram que havia diferenças significativas, teste ANOVA 5%, entre as quatro cultivares de papaia baseadas nas macrostruturas e microestruturas das folhas, anatomia da raiz e pecíolo e tamanho e forma dos frutos. O resultado mostrou que as folhas de papaia são hipostomáticas com um padrão anomocítico. A variedade Wilcox é a única cultivar a ter flores masculinas. O fruto da variedade Solo tende a ser mais pequeno enquanto que o Wilcox foi encontrado com tamanhos maiores.