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Les Shigella sont des agents pathogènes humains qui ciblent le tractus gastro-intestinal et induisent une dysenterie bacillaire aiguë connue sous le nom de Shigellose. Les Shigella continuent d'être des causes importantes de diarrhée aiguë dans le monde entier. Par conséquent, cette étude visait à caractériser phénotypiquement et génotypiquement les gènes de résistance aux antimicrobiens des isolats de Shigella, à détecter les gènes d'intégrons, à détecter également les gènes associés à la résistance aux quinolones ainsi que leur profil de virulence. Vingt isolats de Shigella ont été obtenus par l'étudiant en master et ont été diagnostiqués et confirmés par des milieux sélectifs et différentiels. Les colonies suspectes ont été identifiées biochimiquement par le système Api20 E. Une réaction en chaîne par polymérase a été effectuée pour identifier le genre Shigella en utilisant le gène invC comme amorce spécifique, 20 isolats ont été positifs. Des gènes cibles spécifiques ont été utilisés pour différencier les espèces de Shigella, tandis que le gène rfc, le gène wbgZ, le gène rfpB et le gène protéique hypothétique conservé pour Shigella flexneri, Shigella sonnei, Shigella dysenteriae et Shigella boydii, respectivement.