Notre sol, en revanche, est souvent négligé : il regorge de milliards d'organismes microscopiques qui constituent l'environnement le plus riche en biodiversité de la planète. Comme tous les êtres vivants, ils sont également affectés par le changement climatique. Un fait est souvent mentionné lorsque l'on parle du sol : Il y a plus de micro-organismes dans une cuillère à café de sol sain qu'il n'y a d'habitants sur Terre. La matrice des créatures vivantes qui recyclent la vie des plantes et des animaux est incroyablement complexe, avec des bactéries, des protozoaires, des champignons, des actinomycètes, des nématodes et d'autres qui interagissent d'innombrables façons, en grande partie non cartographiées. Le changement climatique est susceptible d'avoir de graves répercussions sur l'abondance, la distribution et le calendrier saisonnier des ravageurs et de leurs ennemis naturels, ce qui modifiera le degré de réussite des programmes de lutte biologique. Les espèces d'insectes phytophages sont naturellement contrôlées par des mécanismes descendants (ennemis naturels) et ascendants (disponibilité et qualité des plantes hôtes).