As cianobactérias são um grupo de microrganismos encontrados em quase todos os habitats. As cianobactérias aerofíticas são capazes de sobreviver em ambientes terrestres, como superfícies artificiais tendo a capacidade de deteriorar estruturas, danificando patrimônios históricos e artísticos. Assim, dados sobre estes microrganismos são de extrema importância, entretanto, a sua disponibilidade já é escassa em ambientes naturais e, considerando ambientes urbanos e patrimônios históricos, este conhecimento é praticamente inexistente. Este estudo objetivou a identificação e caracterização de cianobactérias aerofíticas encontradas em três edifícios históricos da cidade de Salvador, BA, Brasil. Foram coletados fragmentos de revestimentos externos, que apresentavam alterações visuais, para cultivo. Após crescimento de biomassa, foram selecionadas quatro cepas às análises através de microscopia óptica, eletrônica de varredura e transmissão. Foram descritos quatro táxons filamentosos e um cocoide, distribuídos em duas ordens, três famílias e três gêneros com novas descrições tanto para o ambiente aerofítico baiano (Chroococcus) quanto para o ambiente aerofítico brasileiro (Pseudanabaena).