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Este estudo transversal descritivo incide sobre a co-infecção de malária e lesões anais em crianças com menos de 5 anos de idade em Opala. O objectivo é determinar a frequência da co-infecção de malária e lesões anais, identificar os seus aspectos clínicos e avaliar o tratamento médico com base no destino imediato das crianças doentes. Registámos 135 casos de co-infecção, ou seja, 36,7% e 85,2% de RDTs positivos e 13,3% de resultados laboratoriais indisponíveis. As crianças dos 12 aos 23 meses e dos 0 aos 11 meses foram as mais afectadas, com predomínio do sexo feminino. Estes indivíduos apresentaram um quadro clínico de febre, lesões anais e sinais digestivos embaraçosos. Para além da auto-medicação de cloranfenicol com alcalóides da folha de tomate ou sumo de limão, o tratamento médico foi feito com medicamentos anti-maláricos, antibióticos e antipiréticos. Obtivemos 87,4% de cura e 5,2% de morte. Assim, apoiamos a hipótese de co-infecção de malária e salmonelose no caso de lesões anais em crianças com menos de cinco anos de idade.