La caractérisation écologique des mangroves de Ngazidja a été réalisée en vue de fournir une étude complète touchant surtout, l'écologie des palétuviers, leur état de conservation, leur mode d'utilisation, et leur capacité à séquestrer le carbone. L'étude de ces mangroves a été effectuée à partir des inventaires biologiques et des enquêtes ethnobotaniques. En effet, sept espèces de palétuviers réparties dans six familles ont été décrites dans ce travail. L'étude de la régénération naturelle, montre un taux de régénération moyenne chez certains sites et un faible taux chez d'autre. Le réchauffement climatique, expose les zones côtières à des catastrophes naturelles. Face à ces problèmes, ce travail s'efforce de trouver, des solutions efficaces pour atténuer ces phénomènes. Cette étude a porté des données sur l'estimation du carbone stocké par les mangroves de Ngazidja. Les résultats ont montré que la séquestration de carbone est proportionnelle à la densité et la maturité des arbres. Donc, une bonne gestion des mangroves et un reboisement de palétuviers peuvent augmenter d'ici quelques années la quantité de carbone séquestré et par conséquent, réduire le GES.