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A amebíase é uma das doenças tropicais negligenciadas (DTN) que afectam a maior parte das comunidades rurais nos países em desenvolvimento, o que tem constituído um problema de saúde pública para o desenvolvimento humano. Até à data, ainda existem grandes lacunas na compreensão das taxas de prevalência das espécies de Entamoeba em diferentes regiões do mundo, particularmente no continente africano, onde são realizados poucos estudos utilizando métodos moleculares. Para responder a este desafio, é necessário implementar um diagnóstico específico das espécies de Entamoeba, sobretudo nos locais onde estes organismos são endémicos. Com base na informação limitada disponível, parece que ainda são necessários estudos moleculares e genómicos em sinergia com estudos epidemiológicos para compreender melhor a infeção por Entamoeba histolytica. As estirpes do parasita de África ainda precisam de ter o seu genoma sequenciado. A genómica comparativa permitirá provavelmente compreender a patogenicidade de algumas estirpes de E. histolytica em comparação com estirpes não patogénicas. Novas colaborações entre cientistas do mundo desenvolvido e dos países em desenvolvimento são fundamentais para desvendar a epidemiologia do parasita.