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La amebiasis es una de las enfermedades tropicales desatendidas (ETD) que afectan a la mayoría de las comunidades rurales del mundo en desarrollo, lo que ha supuesto un problema de salud pública para el desarrollo humano. Hasta la fecha, sigue habiendo grandes lagunas en la comprensión de las tasas de prevalencia de las especies de Entamoeba en diferentes regiones del mundo, especialmente en el continente africano, donde se han realizado pocos estudios con métodos moleculares. Para hacer frente a este reto, es necesario aplicar un diagnóstico específico de las especies de Entamoeba, sobre todo allí donde estos organismos son endémicos. De la escasa información disponible se desprende que aún son necesarios estudios moleculares y genómicos en sinergia con estudios epidemiológicos para comprender mejor la infección por Entamoeba histolytica. Aún es necesario secuenciar el genoma de las cepas del parásito procedentes de África. La genómica comparativa permitirá probablemente comprender la patogenicidad de algunas cepas de E. histolytica en comparación con cepas no patógenas. Una mayor colaboración entre los científicos del mundo desarrollado y los de los países en desarrollo es clave para desentrañar la epidemiología del parásito.