Apesar do advento da tecnologia moderna na prática endodôntica atual, a especialidade ainda está envolta em controvérsias clínicas e teóricas. As controvérsias na endodontia têm sido várias, algumas resolvidas, outras abandonadas, outras ainda existentes. Não é de se esperar que, num futuro previsível, haja soluções rápidas para as questões aqui analisadas. Por isso, no ensino da endodontia, as instituições académicas e os cursos de formação contínua devem basear-se na ciência e em evidências clínicas de apoio.