El Mercado Común del Sur (Mercosur) otorga a su Sector Educativo la importancia de crear lazos de confianza y lealtad hacía la sub-región latinoamericana; proceso en el cual la cooperación regional posee un rol crucial. Específicamente, la cooperación descentralizada/transfronteriza mercosureña ha estado ligada en sus inicios a la agenda comercial más que a la dimensión social. Este trabajo pretende contribuir a los nuevos debates vinculados a la Cooperación Sur-Sur Descentralizada en carácter transfronterizo y a las formas de gobernanza, para el caso de las zonas de frontera del Mercosur. Atento a ello, se realiza un repaso por la literatura que involucra a las temáticas trabajadas, atendiendo la multi-dimensionalidad de la problemática. Luego se aborda la historia del Sector, su organización y la política de cooperación para enmarcar las iniciativas principales de cooperación descentralizada en el campo educativo, las cuales plantean la necesidad de reconocer sus desafíos y oportunidades ante la adopción de formas de gobernanza genuinas a partir de la agenda social. Así este estudio podría resultar útil para los profesionales de las ciencias sociales y humanidades en general.