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Le dérèglement et le dysfonctionnement du système immunitaire sont considérés comme l'un des principaux effets à long terme de COVID-19. Les effets sur le système immunitaire ont été bien documentés au début de la pandémie, mais il y avait un manque de clarté sur la façon dont les infections par COVID-19 affectaient spécifiquement le système immunitaire et les implications potentielles pendant et après l'infection. Au début de la pandémie, il existait deux théories principales concernant les causes sous-jacentes des maladies graves et des décès dus à COVID-19 : une réponse immunitaire hyperactive et un système immunitaire affaibli. Le premier facteur était associé à un système immunitaire trop actif. On a constaté très tôt que de nombreuses personnes atteintes d'une forme grave de COVID-19 ont fini par développer un SDRA (syndrome de détresse respiratoire aiguë), qui ressemble beaucoup au SDRA provoqué par le syndrome de libération de cytokines (SRC) et à la lymphohistiocytose hémophagocytaire secondaire (sHLH) observée chez les patients atteints du SRAS-CoV et du MERS-CoV (qui est également un effet secondaire courant chez les patients cancéreux soumis à des thérapies à base de cellules CAR-T).