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Die effektivste und gebräuchlichste Methode zur Bewertung von Umweltproblemen ist die Langzeitbewertung der Wasserqualität, da die räumlich-zeitlichen Schwankungen der hydrochemischen Parameter und biologischen Variablen eindeutig zugeordnet werden können und in Zukunft für die Forschung zur Bewertung des Verschmutzungszustands hilfreich sein können. Der hydrochemische Zustand von Ästuaren variiert sowohl zeitlich als auch räumlich, und die Wasserqualität wird in der Regel auf der Grundlage physikalischer, chemischer und biologischer Faktoren und in Abhängigkeit von der Entfernung von der Küste sowie der Gezeitenphase beschrieben, wobei die Wasserqualität der Gewässer unterschiedliche Reaktionen zeigt. Die Abundanz und die Zusammensetzung des Phytoplanktons sind je nach Jahreszeit, Ort und Jahr unterschiedlich. Millionen von Arten wurden im Ökosystem der Flussmündungen entdeckt, und noch immer werden täglich viele neue Arten erforscht.