Honden die besmet zijn met babesiose hebben bewijs van acute nierbeschadiging en hartfalen. Nierbeschadiging wordt gekenmerkt door de aanwezigheid van niertubercellen, proteïnurie en variabele enzymurie en azotemie. Oorzaken van de nierschade worden toegeschreven aan een combinatie van verminderde glomerulaire filtratiesnelheid, anemische hypoxie en met-hemoglobine. De renale hemodynamica is ook eerder abnormaal wanneer er sprake is van een hartfalen, wat bij babesiose geassocieerd lijkt te zijn met een myocardinfarct. Cardiale disfunctie kan worden aangetoond door middel van verhoogde serum cardiale troponines, cardiale histopathologie en ECG-veranderingen.