Le bassin fluvial a une hydrologie complexe composée d'environ 84% d'Abay/Blue et 16% de White, le Nil étant son principal affluent, ainsi que d'autres zones humides et lacs divers. Pour faire face aux épidémies de toute maladie transmissible, l'Ethiopie disposait de moins de 12 laboratoires régionaux de surveillance des maladies sous l'égide de l'Institut national de santé publique avant les pandémies de covid-19. La couverture des services de santé de base est faible dans tout le Soudan et extrêmement limitée dans certaines régions du Sud-Soudan et du Darfour. Le seul pays disposant de meilleures infrastructures de santé est l'Égypte, dont la couverture n'était pas optimale. Par conséquent, la région doit se concentrer sur l'intégration du système de surveillance et de contrôle des maladies en se concentrant sur l'amélioration de l'état actuel des infrastructures sanitaires ; un système intégré de surveillance et de contrôle des maladies doit être spécialement mis en place entre l'Éthiopie, le Soudan et l'Égypte au-delà de la coopération régionale. L'attitude des gouvernements régionaux d'Éthiopie, du Soudan et d'Égypte doit tourner autour des questions de coopération plutôt que de politiser le don de l'eau, à moins que le déclenchement d'une pandémie ne soit aggravé par le statut socio-économique, les conditions climatiques et la démographie de la région.
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