Se investigaron los efectos de la desinfección natural de aguas residuales en ambientes marinos sin el proceso de cloración antes de ser descargadas al océano por medio de sistemas de emisario submarino. Se examinó la relación de de tres (3) factores naturales (Intensidad de luz, salinidad, proporción volumétrica de la mezcla de agua residual y agua de mar) con la tasa de decaimiento bacterial para la desinfección de aguas residuales en un ambiente marino. Se creó una herramienta en matlab que permite encontrar la tasa de decaimiento de E. Coli de acuerdo a los resultados de la experimentación. La herramienta se utilizó para las condiciones de vertimiento del emisario submarino de Santa Marta donde se encontró una tasa de decaimiento de 0,00357 min-1 para el fondo, 0,010665 min-1 para profundidades medias y 0,013887 min-1 para la superficie, igualmente se estimaron los valores de t90 de 283 min, 94 min y 72 min respectivamente.