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Las nuevas metodologías analíticas deben tener una alta sensibilidad para poder ser utilizadas para el diagnóstico temprano de enfermedades. Es por ello que la utilización de Sistemas Organizados debido a que pueden modificar las propiedades fisicoquímicas de los sustratos con los cuales interaccionan, brindan ventajas para su determinación y cuantificación. En la presente obra, producto del trabajo de tesis de Doctorado en Ciencias Químicas, se expone el estudio de interacción entre sustratos de interés biológico y farmacéutico, tal como indoles y benzotiazoles, con receptores macrocíclicos (ciclodextrinas nativas y modificadas; y calixarenos). Además, basado en esta Investigación, se expone el desarrollo de un nuevo Método Supramolecular Analítico en muestras reales.